Master pro (M2) Expertise et ingénierie des systèmes d’information en santé
http://foad.refer.org/rubrique96.html
Ticket Foad : 161 :
Nous avons à utiliser le logiciel de calcul scientifique R (qui est dans la distribution Ubuntu). Pour un enseignement qui aura lieu le 22 novembre nous allons avoir à utiliser le package "mice" de ce logiciel (téléchargeable à l'adresse suivante : http://cran.r-project.org/src/contrib/Descriptions/mice.html). Je ne sais pas si celui-ci est directement intégré dans la distribution Ubuntu, mais je pense que non.
Ticket Foad : 305 :
Effectivement l'essentiel est que les étudiants puissent développer en PHP/MySQL. Donc un serveur apache2/php5/mysql5 où les étudiants peuvent au moins:
- administrer eux-même leurs bases mysql et les accés
- redemarrer apache à la demande
- mettre les fichiers où il veulent sous la racine
- qui s'y colle pour faire une image virtualbox/vz standard CNF "je débute en php" ?
Installation de R puis de la bibliothèque ''mice'' (Gutsy)
- installer R :
$ sudo aptitude install r-recommended
télécharger la dernière version depuis http://cran.cict.fr/src/contrib/Descriptions/mice.html (prendre le .tar.gz Package source) :
$ cd /tmp $ wget http://cran.cict.fr/src/contrib/mice_1.16.tar.gz
- installer le package :
$ cd /tmp $ sudo R CMD INSTALL -l /usr/local/lib/R/site-library/ mice_1.16.tar.gz * Installing *source* package 'mice' ... ** R ** data ** inst ** preparing package for lazy loading Loading required package: MASS Loading required package: nnet Loading required package: nlme ** help >>> Building/Updating help pages for package 'mice' Formats: text html latex example complete text html latex example glm.mids text html latex example (...) nhanes2 text html latex pool text html latex example ** building package indices ... * DONE (mice) - tester : lancer R et charger le module
$ R R : Copyright 2006, The R Foundation for Statistical Computing Version 2.3.1 (2006-06-01) ISBN 3-900051-07-0 > library(mice) Loading required package: MASS Loading required package: nnet Loading required package: nlme MICE V1.14 library Copyright (2004) TNO Prevention and Health, Leiden This library is distributed under the GNU General Public License (version 2) Loading required package: Hmisc Warning message: there is no package called 'Hmisc' in: library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical = TRUE, > q() Save workspace image? [y/n/c]: n
- il semble manquer le module hmisc, qui est lui déjà packagé :
$ sudo aptitude install r-cran-hmisc
on relance R et on charge le module mice :
$ R
R : Copyright 2006, The R Foundation for Statistical Computing
Version 2.3.1 (2006-06-01)
ISBN 3-900051-07-0
> library(mice)
Le chargement a nécessité le package : MASS
Le chargement a nécessité le package : nnet
Le chargement a nécessité le package : nlme
MICE V1.14 library Copyright (2004) TNO Prevention and Health, Leiden
This library is distributed under the GNU General Public License (version 2)
Le chargement a nécessité le package : Hmisc
Hmisc library by Frank E Harrell Jr
Type library(help='Hmisc'), ?Overview, or ?Hmisc.Overview')
to see overall documentation.
NOTE:Hmisc no longer redefines [.factor to drop unused levels when
subsetting. To get the old behavior of Hmisc type dropUnusedLevels().
Attachement du package : 'Hmisc'
The following object(s) are masked from package:mice :
oldUnclass .R. .SV4.
The following object(s) are masked from package:stats :
ecdf
Attachement du package : 'mice'
The following object(s) are masked _by_ package:Hmisc :
oldUnclass .R. .SV4.
>
Epi Info 6
- Installer wine version gutsy du site winehq
Installer EpiInfo6 avec wine
- Lancer avec dosemu. Voir dosbox, et mettre des raccourcis.
Epi Info 3.4.3
- Hum, on peut rêver là...