Modifications entre les versions 16 et 17
⇤ ← Version 16 à la date du 2008-03-13 17:40:49 →
Taille: 4414
Éditeur: MatthieuSchneider
Commentaire:
← Version 17 à la date du 2008-11-14 22:13:04 → ⇥
Taille: 1422
Éditeur: ThomasNoël
Commentaire: juste au cas où...
Texte supprimé. Texte ajouté.
Ligne 19: Ligne 19:
= Installation de R puis de la bibliothèque ''mice'' (Gutsy) = = Installation de R et des bibliothèques =
Ligne 21: Ligne 21:
 1. installer R :
 {{{
$ sudo aptitude install r-recommended
}}}
 1. télécharger la dernière version depuis http://cran.cict.fr/src/contrib/Descriptions/mice.html (prendre le .tar.gz ''Package source'') :
 {{{
$ cd /tmp
$ wget http://cran.cict.fr/src/contrib/mice_1.16.tar.gz
}}}
 1. installer le package :
 {{{
$ cd /tmp
$ sudo R CMD INSTALL -l /usr/local/lib/R/site-library/ mice_1.16.tar.gz
* Installing *source* package 'mice' ...
** R
** data
** inst
** preparing package for lazy loading
Loading required package: MASS
Loading required package: nnet
Loading required package: nlme
** help
 >>> Building/Updating help pages for package 'mice'
     Formats: text html latex example
  complete text html latex example
  glm.mids text html latex example
(...)
  nhanes2 text html latex
  pool text html latex example
** building package indices ...
* DONE (mice)
}}}
 1. tester : lancer R et charger le module
 {{{
$ R

R : Copyright 2006, The R Foundation for Statistical Computing
Version 2.3.1 (2006-06-01)
ISBN 3-900051-07-0

> library(mice)
Loading required package: MASS
Loading required package: nnet
Loading required package: nlme
MICE V1.14 library Copyright (2004) TNO Prevention and Health, Leiden
This library is distributed under the GNU General Public License (version 2)
Loading required package: Hmisc
Warning message:
there is no package called 'Hmisc' in: library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical = TRUE,
> q()
Save workspace image? [y/n/c]: n
}}}
 1. il semble manquer le module hmisc, qui est lui déjà packagé :
 {{{
$ sudo aptitude install r-cran-hmisc
}}}
 1. on relance R et on charge le module ''mice'' :
{{{
$ R

R : Copyright 2006, The R Foundation for Statistical Computing
Version 2.3.1 (2006-06-01)
ISBN 3-900051-07-0

> library(mice)
Le chargement a nécessité le package : MASS
Le chargement a nécessité le package : nnet
Le chargement a nécessité le package : nlme
MICE V1.14 library Copyright (2004) TNO Prevention and Health, Leiden
This library is distributed under the GNU General Public License (version 2)
Le chargement a nécessité le package : Hmisc
Hmisc library by Frank E Harrell Jr

Type library(help='Hmisc'), ?Overview, or ?Hmisc.Overview')
to see overall documentation.

NOTE:Hmisc no longer redefines [.factor to drop unused levels when
subsetting. To get the old behavior of Hmisc type dropUnusedLevels().

Attachement du package : 'Hmisc'


        The following object(s) are masked from package:mice :

         oldUnclass .R. .SV4.


        The following object(s) are masked from package:stats :

         ecdf


Attachement du package : 'mice'


        The following object(s) are masked _by_ package:Hmisc :

         oldUnclass .R. .SV4.

>
}}}		  Cf [[SergheiMihai/PackageRMarseille]]

Master pro (M2) Expertise et ingénierie des systèmes d’information en santé

http://foad.refer.org/rubrique96.html

Ticket Foad : 161 :

  • Nous avons à utiliser le logiciel de calcul scientifique R (qui est dans la distribution Ubuntu). Pour un enseignement qui aura lieu le 22 novembre nous allons avoir à utiliser le package "mice" de ce logiciel (téléchargeable à l'adresse suivante : http://cran.r-project.org/src/contrib/Descriptions/mice.html). Je ne sais pas si celui-ci est directement intégré dans la distribution Ubuntu, mais je pense que non.

Ticket Foad : 305 :

  • Effectivement l'essentiel est que les étudiants puissent développer en PHP/MySQL. Donc un serveur apache2/php5/mysql5 où les étudiants peuvent au moins:

  • administrer eux-même leurs bases mysql et les accés
  • redemarrer apache à la demande
  • mettre les fichiers où il veulent sous la racine
  • qui s'y colle pour faire une image virtualbox/vz standard CNF "je débute en php" ?

Installation de R et des bibliothèques

Epi Info 6

  • Installer wine version gutsy du site winehq

  • Installer EpiInfo6 avec wine

  • Lancer avec dosemu. Voir dosbox, et mettre des raccourcis.

Epi Info 3.4.3

  • Hum, on peut rêver là...

FOAD/EISIS (dernière édition le 2008-11-14 22:13:04 par ThomasNoël)